Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms