Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms