Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms