Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XIRP2A4UGR9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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