Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL13Q9P2N7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms