Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms