Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms