Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms