Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms