Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms