Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms