Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATL2Q8NHH9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATL2Q8NHH9 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATL2Q8NHH9 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATL2Q8NHH9 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATL2Q8NHH9 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms