Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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TMIEQ8NEW7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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TMIEQ8NEW7 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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TMIEQ8NEW7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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TMIEQ8NEW7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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TMIEQ8NEW7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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TMIEQ8NEW7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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TMIEQ8NEW7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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TMIEQ8NEW7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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TMIEQ8NEW7 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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