Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC112Q8NEF3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms