Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTD1Q8N815 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms