Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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SNX20Q7Z614 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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SNX20Q7Z614 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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SNX20Q7Z614 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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SNX20Q7Z614 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX20Q7Z614 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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SNX20Q7Z614 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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SNX20Q7Z614 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX20Q7Z614 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX20Q7Z614 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX20Q7Z614 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX20Q7Z614 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX20Q7Z614 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX20Q7Z614 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX20Q7Z614 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX20Q7Z614 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX20Q7Z614 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX20Q7Z614 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX20Q7Z614 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX20Q7Z614 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX20Q7Z614 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX20Q7Z614 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX20Q7Z614 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX20Q7Z614 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX20Q7Z614 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX20Q7Z614 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX20Q7Z614 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX20Q7Z614 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX20Q7Z614 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX20Q7Z614 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX20Q7Z614 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX20Q7Z614 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX20Q7Z614 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX20Q7Z614 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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