Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms