Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms