Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms