Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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NEDD8Q15843 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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NEDD8Q15843 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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