Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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