Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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BRD3Q15059 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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