Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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