Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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