Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms