Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms