Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPZ1P61923 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPZ1P61923 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPZ1P61923 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPZ1P61923 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPZ1P61923 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPZ1P61923 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPZ1P61923 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPZ1P61923 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPZ1P61923 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPZ1P61923 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms