Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC4P56524 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms