Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms