Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGDP52209 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGDP52209 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms