Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUFMP49411 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUFMP49411 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUFMP49411 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUFMP49411 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUFMP49411 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUFMP49411 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUFMP49411 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUFMP49411 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUFMP49411 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms