Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTBP49356 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTBP49356 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTBP49356 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTBP49356 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTBP49356 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNTBP49356 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTBP49356 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTBP49356 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTBP49356 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTBP49356 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTBP49356 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTBP49356 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTBP49356 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTBP49356 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTBP49356 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTBP49356 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTBP49356 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTBP49356 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTBP49356 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTBP49356 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTBP49356 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTBP49356 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms