Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGM1P36871 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGM1P36871 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms