Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PLNP26678 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms