Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPI1P17947 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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SPI1P17947 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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