Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPB42P16452 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPB42P16452 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPB42P16452 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPB42P16452 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPB42P16452 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPB42P16452 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPB42P16452 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPB42P16452 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPB42P16452 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPB42P16452 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPB42P16452 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPB42P16452 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EPB42P16452 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPB42P16452 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EPB42P16452 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPB42P16452 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EPB42P16452 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPB42P16452 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms