Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYBBP04839 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYBBP04839 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYBBP04839 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYBBP04839 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYBBP04839 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYBBP04839 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYBBP04839 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYBBP04839 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYBBP04839 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYBBP04839 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYBBP04839 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYBBP04839 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYBBP04839 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYBBP04839 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYBBP04839 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYBBP04839 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYBBP04839 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYBBP04839 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYBBP04839 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYBBP04839 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYBBP04839 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CYBBP04839 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYBBP04839 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYBBP04839 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYBBP04839 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYBBP04839 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYBBP04839 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYBBP04839 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYBBP04839 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYBBP04839 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYBBP04839 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYBBP04839 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYBBP04839 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms