Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms