Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 MCEE-201ENST00000244217 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AC024267.5-201ENST00000579154 599 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AP000842.4-201ENST00000638781 748 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 KCNMB3-201ENST00000314235 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 HACL1-206ENST00000435217 1269 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AC005066.1-201ENST00000613582 1007 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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