Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.8 ms