Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1Q9UJ41 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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RABGEF1Q9UJ41 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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RABGEF1Q9UJ41 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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RABGEF1Q9UJ41 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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