Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms