Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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