Protein–RNA interactions for Protein: Q99578

RIT2, GTP-binding protein Rit2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIT2Q99578 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIT2Q99578 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIT2Q99578 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms