Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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RABGGTAQ92696 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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RABGGTAQ92696 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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RABGGTAQ92696 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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