Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms