Protein–RNA interactions for Protein: Q86YV5

PRAG1, Tyrosine-protein kinase PRAG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAG1Q86YV5 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms