Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms