Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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