Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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